Curriculum vitae
Expériences
Depuis 2023
Bio-informaticienne senior,
Yemaachi Biotech
En tant que Bio-informaticienne Senior, je contribue à la croissance du département de bio-informatique et d'apprentissage automatique chez Yemaachi Biotech pour accélérer le développement de stratégies de détection et de traitement du cancer, dans le but ultime de réduire le fardeau économique du cancer sur le continent africain.
2021 - 2023
Chef Bio-informaticienne / Bio-informaticienne,
My Intelligent Machines
En tant que bioinformaticien (juillet 2021 - mai 2022) puis chef bioinformaticien (mai 2022 - janvier 2023) chez MIMS, j'ai travaillé sur le développement de systèmes interactifs d'intelligence augmentée, permettant des simulations biologiques précises dès les premières étapes du développement de médicaments pour aider les entreprises à créer des thérapies ciblées et personnalisées.
2019 - 2021
Chercheure postdoctorale,
Centre de pharmacogénomique Beaulieu-Saucier, Institut de Cardiologie de Montréal, Université de Montréal
J'étais responsable de la conception, du développement et de la documentation d'outils de randomisation mendélienne et de pheWAS, ainsi que de l'intégration d'outils analytiques sur la plateforme fédérée PGx. J'ai élaboré des flux de travail et des outils pour l'analyse quantitative et qualitative de données génomiques afin d'étudier les facteurs de risque communs dans les maladies cardiovasculaires et les cancers.
2010 - 2014
Bioinformaticien,
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA, Évry, France)
En tant que bioinformaticien au Centre National de Séquençage (avril 2013 - octobre 2014), j'ai créé des flux de travail pour l'analyse quantitative et qualitative de données métagénomiques, incluant la prédiction de gènes, la comparaison de métagénomes et l'attribution taxonomique en utilisant la technologie de séquençage à haut débit. Pendant mon mandat en tant que bioinformaticien au Centre National de Séquençage (septembre 2010 - février 2012), j'ai contribué au développement de logiciels pour le traitement des données de séquençage de nouvelle génération (NGS) et l'analyse des polymorphismes pour la génétique humaine (étude du cancer du foie et de la maladie d'Alzheimer).
2008 - 2010
Stagiaire en bioinformatique,
Laboratoire de Mathématique, Informatique et Génome, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA, Jouy-en-Josas, France)
En tant que stagiaire en bioinformatique (septembre 2008 - août 2010), j'ai contribué au développement d'un moteur de recherche basé sur des techniques de traitement du langage naturel (NLP) conçu pour les chercheurs en microbiologie, en m'appuyant sur des enquêtes bibliographiques et une classification automatique. Pendant mon poste d'analyste (avril 2008 - septembre 2008), j'ai généré et traité des ressources termino-ontologiques et rédigé des procédures détaillant le processus de fusion d'ontologies.
2006 - 2008
Conférencière en biologie moléculaire,
Palais de la découverte (Paris, France)
En tant que conférencier en biologie moléculaire, j'ai donné des conférences sur la génétique au grand public (groupes de dix à trente personnes). J'ai également préparé des cours et des travaux pratiques.
Éducation
2015 - 2019
Doctorat en Médecine Moléculaire, Université Laval, Québec, Canada
Projet: Development of tools and methodologies for a better understanding of the genetic elements underlying susceptibility to breast cancer.
Supervision: Pr. Arnaud Droit and Pr. Jacques Simard.
2008 - 2010
Master Biologie-Santé, spécialité bio-informatique, Université de Rouen, Mont-Saint-Aignan, France
Projet: Development d'outil pour l'exploration bibliographique.
Supervision: Pr. Claire Nédellec and Pr. Philippe Bessières.
2006 - 2007
Master Sciences & Management, Université de Pierre et Marie Curie, Paris, France
Projet : Gestion des connaissances pour le travail collaboratif en biologie.
Supervision : Pr. William Turner.
1996 - 2000
Licence professionnelle en Biotechnologie, Université de Pierre et Marie Curie, Paris, France
Project: Développement d'une PCR pour séquencer le gène du récepteur de la vitamine D humaine.
Supervision: Pr. Michelle Garabédian et Pr. Frédéric Jehan.
Compétences et Expertise
Bio-informatique
-
Analyse de données de séquençage à haut débit (GWAS, WES, PheWAS,...)
-
Analyse de données métagénomiques
-
Développement d'outils analytiques
-
Randomisation mendélienne
-
Génomique comparative
-
Modèles pour l'intégration de données omiques hétérogènes
-
Intégration d'outils analytiques sur des plateformes
Apprentissage automatique en bio-informatique
-
Développement de systèmes interactifs d'intelligence augmentée
-
Simulations biologiques de précision
-
Thérapies personnalisées dans le développement de médicaments
Programmation et visualisation de données
-
Programmation et scriptage pour l'analyse de données (Bash, Nextflow, R)
-
Visualisation de données omiques hétérogènes
-
Analyse et visualisation de données (ggplot, graphviz, shiny, Plotly)
-
Thérapies personnalisées dans le développement de médicaments
Enseignement
-
Enseignement en biologie moléculaire, génétique et Linux
-
Préparation de cours et de travaux pratiques
-
Enseignement à des étudiants diplômés et au grand public